最近几天,科技日报记者从邵逸夫医院获悉,该院感染科余教授和博士研究组通过首个耐利奈唑胺头形葡萄球菌核心基因组多位点分型系统,揭示了该菌的克隆,传播和耐药机制,为多重耐药病原菌的流行病学监测提供了可靠的分子分型工具相关研究论文最近几天发表在国际期刊《自然·通讯》上
头形葡萄球菌是一种常见的凝固酶阴性葡萄球菌,可导致乳腺炎,并发皮肤软组织感染,人工关节感染等严重感染长期使用抗菌药物利奈唑胺会引起头形葡萄球菌耐药核心基因组多位点分型系统是一种高分辨率的物种分型技术,它以基于大量菌株的核心基因组作为序列分型标记利用核心基因组多位点分型系统监测细菌耐药性,有助于预测细菌耐药性的发展趋势,阐明耐药机制,指导抗菌药物的研发
在这项研究中,研究小组应用了三种不同的头形葡萄球菌基因组经过初步筛选和验证基因组集合筛选,最终建立了包含1492个基因的核心基因组多位点分型系统为了验证该系统,研究组收集了所有耐利奈唑胺头形葡萄球菌的基因组作为测试基因组集,并纳入了杭州,上海和哈尔滨医院的菌株核心基因组
虽然菌株间存在很大的时空差异,但绝大多数耐利奈唑胺头形葡萄球菌属于同一克隆,即细菌具有相同的进化分支团队建立的系统分析鉴定发现了一个重要的耐药克隆,并将其命名为L克隆陈艳介绍道
陈艳表示,基于核心基因组单核苷酸多态性的系统发育分析得出的分化结果与头形葡萄球菌核心基因组多位点分型系统得出的结果一致——大多数L—克隆菌株携带利奈唑胺耐药基因,该基因由菌株中特定的环状DNA分子携带,仅存在于L—克隆中。
虽然L—clone目前仅在中国发现,但它已经构成了临床威胁,迫切需要进行更广泛的国际流行病学调查,以监测L—clone的全球流行和传播陈艳介绍,借助完善的核心基因组多位点分型系统,未来人们可以更好地监测多重耐药头形葡萄球菌克隆的传播
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